众人离开北郎的房间后，就依次去了其他人的房间搜查。期间柯南不知道是出于侦探的职业素养，还是眼里只有案子，并没有被刚才的事影响行动，依旧认真着查找每一间房，想要找到线索。
在柯南没注意的身后，知道柯南真实身份的小兰，看着柯南那认真的背影，眼神有些黯淡。刚才虽然说她有一瞬间的动摇，但很快就坚定了自己的信念，尤其是看到柯南吃醋，慌乱的样子，更是坚定了她的决心。但没想到柯南他转眼又把心思全部扑倒了案子上……
感受到肩膀上传来的温暖，小兰转头看见山本拓关切的目光，耳边响起山本拓关心的话语，“怎么了？小兰，身体不舒服吗？”
小兰勉强笑了笑，“没事，就是有些累……”
“要不你先回去休息，放心不会再有案子了。”山本拓关心的道。
“啊…还是算了吧，应该马上就好了吧！”小兰回答道。
“嗯，那好吧，确实马上就可以结案了”山本拓看着此时露出一副了然神色的柯南说道。
而这个时候的柯南在解决案情后，也想起来了还有山本拓这个潜在的情敌，挑衅的看了山本拓一眼。似乎在他心中一切都可以用推理能力来比较高低。
山本拓没理会柯南那小孩般的心思，看见柯南了然的样子他就知道案子可以结案了，此时他开始认真又不着痕迹的盯着毛利小五郎，如果估计没错，沉睡的小五郎就要登场了……
没过多久，众人就搜查完毕，离开秋江的房间，还没走多远，柯南就叫住了毛利，说他在秋江的房间里有发现，把毛利骗了过去。山本拓看见之后也不着痕迹的跟了过去。
在门口他看见柯南打开麻醉手表偷袭了毛利，然而就在麻醉针要射到毛利的脖子上时，毛利的脖子不被人察觉的闪了一下，躲过了麻醉针。然后毛利配合的晕倒了。
看完想看的后，为了不被别人发现，山本拓快速回到众人得队伍中，心中感叹，我这个叔叔果然是真的厉害，我就说嘛，连琴酒那货都能抗住麻醉针，没道理叔叔不行…
山本拓刚回队伍，柯南刘跑到小兰身边说道：“小兰姐姐叔叔说他还有很重要的事情要宣布，请大家十分钟后到秋江的房间集合，拜托你喽！！”说完也不管，小兰答不答应，就跑回来房间开始准备。
有点不知所措的小兰看向山本拓，山本拓则微笑的回应：“没事，喔们去找大家吧，这个案子可以结案。估计如果今天这件案子能登报的话，叔叔就成为了封号侦探了。”
“哈？”小兰更加不懂了，不过山本拓没有再多解释什么，拉着小兰就去餐厅叫人了。
没一会儿，众人就到了秋江的房间，开门进来刘看见毛利坐在老板椅上，背对着众人。
藏在毛利身下的柯南，见到众人都到齐了，就用变身蝴蝶结，模仿着毛利的声音说道：“大家都已经到齐了，那么我现在就要宣布，谁才是船上这三起案件的杀人凶手。”
“凶手到底是谁！？”
“不是小武吗？”
“一定是小武，对不对？”
众人闻言开始嘈杂。
“先别慌……在说出凶手名字前，我们先来回顾一下这三次案件……”柯南用毛利的声音说道，“首先是豪藏老爷被杀死在里面反锁的船舱……从门槛上的血迹来看…极有可能是豪藏老爷为了躲避凶手追杀逃进房间并反锁之后，血流过多而死亡…而掉在门口的花……”
“没错！那朵花就能证明小武是凶手……”秋江插嘴道。
“不过有件事很奇怪…豪藏老爷是在屋外被刺杀，但走到却没有血迹……”柯南没有理会秋江的插嘴继续说道。
“那可能是凶手为了避免尸体太早被发现会擦掉的吧？”祥二说道。
“对呀！绝对是小武干的！！”秋江也说道。
“我所要强调的并非是没有血迹这些事情……”柯南说道，“而是……花是故意放在擦掉血迹的走廊上…如果花是凶手在作案中不小心掉落的话那没花说。但…他还仔细擦过走廊…照理说，应该会被发现…不可能还特意留下证据……很明显的，凶手是擦掉血迹之后才把花放在现场！也就是说，他有意的把杀人罪名嫁祸给小武！！”
众人听了都是震惊，山本拓就有些想打哈欠，说了这么多都没什么有用的，还真是小孩子心显摆。
柯南不知道他精彩的推理被山本拓定义为小孩子的显摆，继续用毛利的声音说道：“再来是龙男被杀死在甲板上……这次凶手并没有留下凶器之类的证据…与另两次费心在断电器上动手脚及留下证物不同……”
“若这三起案件是同一人所为…那杀掉龙南，其实并不在凶手计划中…至于，龙男之所以被杀，答案就在这个箱子里…”说着柯南就拿出祥二的厨具箱。
打开厨具箱，柯南继续说道：“你们看！有两把刀子不见了！一把掉在了第三起事件的现场，另一把还没找到…结合柯南他们在发现龙男尸体前听见的东西落海的声音，我们可以这样想……被丢到海里的就是还没找到的那把刀…假设龙男看到了不该看到的事情…也就是他目睹凶手将杀害豪藏老爷的凶器丢入海里……那自然逃不过凶手的魔爪啊！！”
“可是，龙男被杀之后，小武同时也不在仓库呀！”
“就是嘛！小武是嫌疑最大的！！”
众人还是认为凶手是小武。
“你们别忘了，仓库是从外面锁上的…”柯南反驳道，“除非有人帮他开锁，否则小武根本出不来……”
“那是谁？是谁开的门？”众人激动的问道。
“很可能是凶手……”柯南道，“若之前的假设没错，那龙男原本不是凶手杀害的对象…也就是说命案发生在小武还关在仓库期间……凶手为了脱罪，于是又想办法嫁祸黑小武…所以，他就打开仓库的锁…故意误导大家怀疑小武！！”
“如果小武没杀人，那他为什么要逃走！？到现在还不见人影！！”众人还是觉得小武才是凶手。
“关于这点还是请他本人来说吧！出来吧小武，那你逃出仓库那时的事跟大家说吧！”柯南说道。
之后小武按你衣柜里出来，说了当时的事情，在他说完之后众人有些相信他不是凶手，这时爱子心切的麻理子问道：“到底是谁？为什么要对一郎下毒手？”
“因为一郎就是凶手，他担心事情会暴露，因此想出了这个计策，帮自己脱罪……但是他万万没想到这么做却等于自掘坟墓！！”柯南说道，“一郎，请你重复一下你遇刺后的证词…”
“呃…当时实在太暗，根本看不清凶手的脸和体型，也没看见发亮的东西”一郎回答道。
“你们不觉得一郎的证词又问题么？如果以一郎的说法，凶手是看不见他的，在没有灯光的情况下，的确很难下手……”柯南说道，“但他却准确的刺中了一郎的右腿…而且和前两起事件不同的是这次凶手没有带走凶器，不…应该说是没办法带走…因为他的腿受伤了，动不了…所以行凶的只可能是一郎本人。”
柯南顿了顿，让众人消化消化，继续说道：“而且豪藏及龙男的命案也全是一郎的杰作！”
柯南那出一块手帕展开说道：“这里面就是证据，这是在豪藏老爷尸体旁边发现的……面包屑…一郎是学美术的……而且就在豪藏老爷被害前，他曾在甲板上用炭笔作画…而他比划是用面包来修改的…在作画时一定会有面包屑掉进袖子里…所以，很可能是一郎，在行凶时…不小心从袖口掉出的…而且，面包屑上还沾有木炭……”
“不，不会是一郎。一郎他没有杀他爷爷的动机啊！”麻理子不相信的说道。
“关于动机，我一开始也很疑惑，知道我看见了那些画…”柯南说着就拿出了一郎的画作。
一郎看见画作彻底崩溃，承认自己的罪行，至于动机则是因为他喜欢夏江，虽然他没有向夏江表白过，但他向豪藏请求过让豪藏答应他和夏江结婚，可是豪藏不但没同意，还说他“癞蛤蟆想吃天鹅肉”，不久之后豪藏竟然同意夏江和小武结婚！就这样他根极了豪藏和小武。
最后一郎绝望的叫声，响边了客轮的每一个角落…羞涩的少年因为无法表达内心的爱，而铸下无可弥补的大错！案件随着邮轮驶入东京，小武被警方带走而结束，而小兰和柯南的情感却从今天开始起了变化………